مسجد شیخ لطف الله دقیقا روبروی عمارت عالی قاپو قرار دارد که کاشیکاری های خاص و حوض وسط آن منعکس کننده تصویر مسجد و عالی قاپومی باشد . دلیل ساخت این مسجد، ارادتی بود که شاه عباس اول به «شیخ لطف اله جبل عاملی» داشت.
چیزی که در مورد این مسجد جالب و عجیب است ، وجود نداشتن صحن و مناره در مسجده که باعث شده تا کاشیکاریهای زیبا و استادانه، فضای مسجد رو به گنبد مربوط کند. یکی دیگر از نکات جالب در مورد این مسجد این است که یک راه زیر زمینی برای ملاقات شاه با شیخ لطف اله و برعکس بین کاخ عالی قاپو و مسجد وجود داشته که الان به دلایل نامعلوم بسته شده است. درجلوی این بنا فضای بزرگی قرار دارد که برای استراحت مناسبمی باشد، بازار عتیقه فروشها و فروشگاههای مخصوص سوغات و ادویه خاص اصفهان در نزدیکی این مسجد قرار دارد.